Попробуй простенькую обрезалку файлов.
Вообще, как-то на дисках с видео тулзами видел простенькую прогу - там выбираешь с какого момента отрезать, и какой отрезок - вот только найти её будет немного проблемно (но по-идее mkv она должна загрузить без проблем).
__________________
 
|