PAM3EC, лучший пакетный конвертер - это батник.

Например, если использовать adpcm-xq.exe, то батник для него:
if not exist output md output
for %%i in ("*.wav") do (
adpcm-xq.exe -e -y -v "%%i" "output\%%i"
)
pause
Если нужен файл без шапки, то добавить еще ключ -r
Кодер:
https://github.com/dbry/adpcm-xq/releases/tag/v0.3
Кодер и батник для него положить в папку с файлами и батник запускать оттуда.
Если данный кодер не подойдет, просто использовать другой, и соответственно в батнике поменять имя и ключи запуска.