Внесу свои пять копеек в тему.
Редкую рыбу нужно ловить при помощи особых движений наживки. Их существует 4 типа и они представлены в мануале по рыбалке. При помощи 4-ого Tec. (так сии движения называются, вероятно, от слова Technic) можно ловить рыбу, превышающую по уровню вашу наживку. К слову, рыбы вроде китов, без использования Tec'ов мне поймать не удавалось.
Возможно, рыба, которую вы ищете, находится на большей глубине, или требует другую наживку - меняйте удочки/наживки. Список на какую наживку какая рыба клюет можно найти на гейм факах.
Существуют также ультимативные наживки, на которые можно поймать всё - Spoon (ложка) и King Frog. Второго вы не получите до самого конца игры, а вот первую можно купить в деревне фей, причем не одну
Манилло в игре не ловится (в отличае от третьего фаера) а приторговывает вещичками за рыбу и за карточки. Причем за карточки у него можно купить действительно мощное снаряжение.