Город Токио, Япония, на дворе 21 век. Интернет уже не часть интереса или необходимость, Интернет это уже виртуальная реальность, это часть реальной жизни известной как Cyberland. Этот цифровой мир разделён на восемь зон важной или совершенно секретной информации, последнее не доступно никому кроме тех кто имеет самый высокий уровень доступа. Вы играете за Alice Minazuki, молодую девушку, студентку, дочь одного из разработчиков Cyberland. Отец обеспечил дочери высокий доступ в самые глубины Cyberland с помощью так называемого Dive System и вместе со своими друзьями, Rena Ohtori и Juri Yagami, - они команда Alice 3, в задачи которой входит поддержание мира и порядка в Cyberland.