Threads Of Fate - это ролевая игра с большим уклоном на Action (Action/RPG), то есть сражения происходят не в пошаговом режиме, как в большинстве игр серии Final Fantasy, а в реальном времени. К тому же присутствует значительный элемент платформера - пытаясь добраться до цели, персонажи должны преодолевать различные препятствия, успех прохождения которых во многом зависит от ловкости и реакции игрока. Геймплей схож с играми серии Mana, другой линейкой SquareSoft, кроме того, наблюдается некоторое сходство с культовыми The Legend Of Zelda (или Alundra и Alundra 2 для PlayStation). Атаки персонажей различаются, Минт использует в качестве оружия чакрамы и хорошо владеет магией, в то время как Руэ, более сильный физически герой, пользуется большим топором. Он также обладает способностью превращаться в разных монстров, над которыми ранее одержал победу. Меню интерфейса и система выбора навыков своим построением напоминают Secret Of Mana.