Пункт 1. Скачай эмулятор - (какой понравится) :
1. PCSXR-1.9.92-win32
2. PCSXR-1.9.93-win32
В каждом архиве, есть папка "BIOS", для запуска игры я выбирал биос - Sony PlayStation BIOS (J)(v4.0)(1997-08-18)[SCPH-7000]
При каждом изменении какого-либо параметра не забываем нажимать кнопку "OK", в некоторых других версиях
этого эмулятора вместо кнопки "OK" присутствует кнопка "ПРИМЕНИТЬ".

Пункт 2. Распаковываем архивы, с эмулятором и папкой BIOS в любую директорию (куда Вам понравиться):

Далее выбираем Bios консоли из папки BIOS (так как образ игры японский, соответственно и биос выбираем японский):

копируем выбранный биос в папку по следующему пути:

(биос должен находится в папке "bios")

Пункт 3. Запускаем эмулятор:
Кликаем по файлу "pcsx.exe"

Пункт 4. Настройка эмулятора:
После запуска эмулятора, появится рабочие окно эмулятора, выбираем "Настройки" (по умолчанию клавиша "C", на клавиатуре):

далее переходим во вкладку - "Плагины и биос" (по умолчанию клавиша "P"):

в появившемся окне:

настраивайте эмулятор (я лично, настраивал только управление, под свой геймпад), настройки видео, звука и т.д.
похожи на настройки эмулятора ePSXe.
Если возникли какие - либо трудности с настройкой перейдите по ссылке: Эмуляторы и их обсуждение.
Далее, очень важно (для запуска именно Parasite Eve 2 (RGR Studio)), указать путь к биос, выделено "красным" (без изменений)

далее кликаем по кнопке "выберете каталог с биос" и указываем путь к папке "bios"

должно выглядеть так (с изменениями):

Второй важный момент:
Выбираем пункт - "Настройка > ЦПУ"

в появившемся окне ставим галочку как, на скриншоте:

Закрываем и перезапускаем эмулятор.
Пункт 5. Запуск Parasite Eve 2 (RGR Studio):
Запускаем эмулятор, Файл>Запустить ISO

и указываем путь к образу диска, выбираем файл */bin.

P.S. Надеюсь, я Вам помог! Приятной игры.
Проверял лично,работает на ОС Windows XP SP3 и Windows 7 x64!]