События развернутся через 6 месяцев после окончания сюжетной линии предыдущей игры серии - Armored Core: Nexus. Две могущественные группы - Альянс и Вертекс борются за мировое господство, а то, кто победит зависит лишь от пилотов футуристических боевых машин, которых называют Ворон (Raven). Именно таким пилотом является ваш персонаж, и вам придется сделать выбор - на чьей стороне вступить в борьбу. Если же вам больше по душе одиночество, то можно выступить и против всех, однако будьте готовы к тому, что кроме борьбы с Альянсом и Вертексом, на вас обрушится гнев остальных Воронов.
Вашей целью будет уничтожение вражеского меха Nine Ball, который впервые был представлен в игре Armored Core: Master Of Arena. В Armored Core: Nine Breaker два главных режима игры: миссия и арена, а каждое из заданий спроектировано по принципам построения игрового процесса серии, будь то патрулирование городских кварталов, уклонение от самонаводящихся ракет или стрельба по плохим парням. Тот, кто сумеет победить этого мека, станут знаменитыми и будут признаны самыми могучими меками в мире. В игре есть два главных основных режима: тренировочный и режим Арена. В тренировочном режиме 150 миссий испытывают мастерство игрока.
Приключение с перспективой от первого лица и элементами РПГ когда герои сражаются с врагами. События игры разворачиваются в подводном мире, которому угрожает опасность в лице некого таинственного существа, об этом главному герою игры Хироки Катаяме сообщает диковинное существо похожее на зайца и которое будет сопровождать в его приключениях. Помимо главного героя и его няшного спутника у Хироки есть и подруга - Юми Асакуру с которой он знакомится в начале игры.